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L'inibitore la cui struttura deve essere determinata è codificata come 0.39. la conoscenza della sua struttura insieme a quella già nota dell'inibitore monomerico codificato come 0.28 può aiutare a capire la loro specificità di inibizione.
le miscele da
0.39 e da 0.28 sono state ottenute tramite trattamento con elastasi e tripsina
dalla
comparazione viene stabilita l'identità di 11 frammenti sulla base dello spettro
dell'isoinibitore 0.28.
assegnazione dei valori di MH+ ai
frammenti peptidici dell'inibitore 0.28
assegnazione dei valori di MH+ ai
frammenti peptidici dell'inibitore 0.39
La differenza riguarda il frammento F10 e potrebbe essere dovuta a sostituzione di una arginina con una glicina, l'assenza poi di un sito di taglio per la tripsina darebbe origine a un frammento + lungo.
| F10 in 0.28 VPIPNPSGDR valore MH+ 1051 |
| F10 in 0.39 VPIPNPSGDGAGV valore MH+ 1179 |
la massa dopo 1
ciclo
a completamento e
conferma dei dati dal FAB-MS viene effettuata un'analisi di seq. dopo
trattamento della miscela con CNBr
in posizione 109
c'è una glicina al posto di una arginina. Manca di due residui aa. che nella
0.28 erano in posizione 115 e 116.
la 0.39 ha 121 residui contro i 123
della 0.28
è identica al 97% differendo per una
sostituzione e due delezioni
