Esperienza di laboratorio

Scopo: misurare la Km e la Vmax per l'enzima fenolo-ossidasi.

Strumenti necessari:

lo spettrofotometro

le micropipette

una soluzione contenente il substrato

le soluzioni hanno le seguenti concentrazioni da me scelte:

20 mM  
2

mM

0.2

mM

una soluzione contenente l'enzima

le cuvette da inserire nello spettrofotometro

 Devo fare una serie di saggi.

Scelgo la concentrazione di substrato. Parto da 5 mM.

Devo sapere:

 

Quant'è il volume di enzima da mettere nella cuvetta? Il volume è fisso: 10 ml di enzima

Quant'è il volume di substrato Vc da mettere nella cuvetta? Il volume lo ricavo sapendo...

 la concentrazione della soluzione contenente il substrato  [S]A  (20 mM), 

la concentrazione di substrato finale da mettere nella cuvetta [S]B (5 mM),

il volume finale che deve raggiungere la cuvetta Vf (1 ml).

 Facendo 5mM · 1ml = 5mmoli, la quantità di substrato da mettere nella cuvetta.

Il volume da prelevare dalla soluzione sarà quindi 5mmoli/20mM =0.25 ml

 

Ovvero             X : 5mmoli = 1ml : 20mM

 

 

Quant'è il volume di soluzione tampone?  

1ml

  -

0.25 ml

-

0.01 ml

=

0.74 ml

 

(volume della cuvetta) -  (volume di substrato)

-

(volume di enzima)

=

volume di soluz.tampone

 

    

-------------------------------------------------

Preparata la cuvetta e miscelato il contenuto, lo spettrofotometro ci darà la DA/min.

Adesso posso ricavare le U.I./ml. da questa equazione:

 

 

-----------------------------------------

I saggi effettuati sono stati i seguenti:

 

n. [S] v=U.I/ml [S]/v
1. 5.000

mM

0.675

7.407

2. 0.500

mM

0.820

0.617

3. 5.000

mM

0.753

6.640

4. 0.500

mM

0.517

0.967

5. 0.500

mM

0.804

0.617

6. 0.100

mM

0.634

0.157

7. 0.010

mM

0.486

0.02

8. 0.020

mM

0.570

0.035

9. 0.040

mM

0.700

0.057

10. 0.050

mM

1.110

0.045

11. 0.030

mM

0.671

0.045

12. 0.005

mM

0.140

0.0357

13. 0.003

mM

0.110

0.027

14. 0.002

mM

0.089

0.022

15. 0.004

mM

0.167

0.024

il grafico evidenzia la necessità di scartare il saggio nº4
, probabilmente anche il saggio nº6, i nº2 e 3 perché 
non si trovano nella zona di iperbole che ci interessa

 

il grafico evidenzia la necessità di scartare il saggio nº4 
e n°10, ricordando che i punti a basso valore sull'asse delle
ordinate hanno l'errore maggiore

 

 

il grafico evidenzia la necessità di scartare il saggio nº4

  

Adesso facciamo gli stessi grafici utilizzando solo i dati che abbiamo ritenuto più validi.

n. [S] v=U.I/ml [S]/v

utilizzazione

1. 5.000

mM

0.675

7.407

NO si trova nella porzione di curva che non mi interessa Ð
2. 0.500

mM

0.820

0.617

valore alto lo prendo in considerazione per la regressione non lineare al computer, ma non per i grafici finali -
3. 5.000

mM

0.753

6.640

NO si trova nella porzione di curva che non mi interessa Ð
4. 0.500

mM

0.517

0.967

NO ritenuto non buono dai grafici precedenti Ð
5. 0.500

mM

0.804

0.617

valore alto lo prendo in considerazione per la regressione non lineare al computer, ma non per i grafici finali -
6. 0.100

mM

0.634

0.157

NO ritenuto non buono dai grafici precedenti Ð
7. 0.010

mM

0.486

0.02

SI   P
8. 0.020

mM

0.570

0.035

SI   P
9. 0.040

mM

0.700

0.057

SI   P
10. 0.050

mM

1.110

0.045

NO ritenuto non buono dai grafici precedenti Ð
11. 0.030

mM

0.671

0.045

SI   P
12. 0.005

mM

0.140

0.0357

SI   P
13. 0.003

mM

0.110

0.027

SI   P
14. 0.002

mM

0.089

0.022

SI   P
15. 0.004

mM

0.167

0.024

SI   P